Родился 8 октября 1846 г. Окончил 1-й кадетский корпус, 2-е военное Константновское училище. Выпущен в 1-й лейб-гренадерский Екатеринославский полк. Окончил Николаевскую академию Генерального штаба (1873 г.). Старший адъютант штаба 2-й гвардейской пехотной дивизии (1874-1878 гг.), участвовал в русско-турецкой войне 1877-1878 гг., в сражении под Горным Дубняком 12 октября 1877 г. был ранен в руку и контужен в голову. Полковник с 1881 г. Начальник штаба 1-й гвардейской пехотной дивизии (1888-1889 гг.), управляющий удельным имением "Массандра" (1889-1890 гг.), командир 95-го пехотного Красноярского полка (1892-1895 гг.). Генерал-майор с 1895 г. Помощник начальника штаба войск гвардии и Петербургского военного округа (1895-1901 гг.), начальник 22-й пехотной дивизии (15 ноября 1901 г. - 23 октября 1904 г.). Генерал-лейтенант с 1902 г. Под его командованием 22-я пехотная дивизия отправилась на Дальний Восток и приняла участие в первых для неё боях русско-японской войны 1904-1905 гг. Однако вскоре В.К. Аффанасович из-за болезни был эвакуирован в Санкт-Петербург, позднее был председателем военно-исторической комиссии по описанию русско-турецкой войны 1877-1878 гг. Умер 3 июня 1908 г. в Наугейме.